Lateral esquerdo de posição, Pedro Santana foi reforço para a equipa de iniciados do SL Benfica em 2014/15 depois de ter representado as categorias de formação do Almada Atlético Clube durante seis épocas. O jogador completou o seu processo formativo no clube da Luz e em 2017/18, apesar de ser júnior/sénior B, foi chamado a dar o seu contributo em algumas partidas pela equipa principal, fazendo a estreia num jogo das competições europeias. Foi cedido a título de empréstimo ao Boa-Hora FC em 2018/19, acompanhando Diogo Valério e André Alves.

Títulos conquistados ao serviço dos Escalões de Formação do SL Benfica:

- 3 Campeonatos Nacionais de Juniores 2015/16, 2016/17 e 2017/18